嘉兴学院工会是学校党委领导下的教职工自愿结合的群众组织，是党联系教职工的桥梁和纽带。学校工会在党委和上级工会的领导、校行政的支持下，按照《中华人民共和国工会法》和《中国工会章程》所赋予的职权，认真贯彻中央和省委关于加强和改进党的群团工作的意见，紧紧围绕学校中心工作，以高校立德树人、凝心聚力为主线，积极推进学校民主决策、民主管理和民主监督，代表和维护广大教职工合法权益，为教职工排忧解难办实事，团结动员广大教职工努力工作、岗位建功，为学校“十四五”发展目标的实现做出贡献。

嘉兴学院工会现有1900多名在职会员，分属18个学院（单位）分工会。2011年12月学校工会被全国总工会评为全国“优秀基层工会”。