嘉兴大学工会是学校党委领导下的教职工自愿结合的群众组织，是党联系教职工的桥梁和纽带。学校工会在党委和上级工会的领导、校行政的支持下，按照《中华人民共和国工会法》和《中国工会章程》所赋予的职权，认真贯彻中央和省委关于加强和改进党的群团工作的意见，紧紧围绕学校中心工作，以高校立德树人、凝心聚力为主线，积极推进学校民主决策、民主管理和民主监督，代表和维护广大教职工合法权益，为教职工排忧解难办实事，团结动员广大教职工努力工作、岗位建功，为建设有特色、善创新的一流应用型综合性大学贡献力量。

嘉兴大学工会现有2000余名在职会员，分属18个学院（单位）分工会。2011年，学校工会被评为全国教科文卫体系统先进工会组织；2020年，被评为全国厂务公开民主管理工作先进单位；2023年，获评全国教科文卫体系统模范职工之家。